Devido a sua posição no corpo, podemos entender que o Chakra é um distribuidor de energia e comandos para os órgãos periféricos a sua vizinhança através dos nadis. Tomemos por exemplo o Básico (Muladhara), ele é o responsável pelo funcionamento dos membros inferiores, sistema reprodutor, órgãos genitais e ânus. Porém, dizer que sua atuação está restrita a somente aos exemplos citados é uma afirmação imprecisa, dentro dos novos entendimentos da vida extrafísica dizemos que o ser humano possui sete corpos e cada um dos Chakras está vinculado a cada um deles. O Chakra básico está vinculado a nosso corpo físico e, portanto tudo que se refere à sustentação (musculatura e estrutura óssea) são de sua responsabilidade.
Nosso sistema linfático, imunológico, tecido sanguíneo, excretor (mais propriamente os rins e bexiga) são de responsabilidade do Chakra Genésico (Swadhisthana). Sistema digestório, baço, tecido cerebral, sistema simpático são comandados por Gástrico (Manipura). Membros superiores, sistema cardíaco, respiratório, parte do sistema imunológico (timo), glândulas mamárias tem como seu centro de comando o Chakra Cardiaco (Anahata). Laringe, faringe, traqueia, vias aéreas superioras, cordas vocais, boca, sistema auditivo (extra fisicamente é responsável pela audiência/clariaudiencia) pertencem ao Laríngeo (Vishudda). Olhos (vidência/clarividência), cabeça, sistema nervoso central, estão sobre a tutela do Chakra Frontal (Ajna) (a maioria das funções deste Chakra está no plano extrafísico). Sistema parassimpático, Chakras, meridianos, nadis, obedecem ao Coronário (Sahasrara) (assim como o Ajna, a maioria de suas funções está no plano astral).
Tem que se ter cuidado para não achar que um Chakra não influencia um determinado órgão que é de competência de outro. O sistema energético humano é muito mais complexo e inter-relacionado do que parece. Vejamos um exemplo de uma disfunção erétil, facilmente seria associado ao básico, contudo verificamos que o problema é de causa emocional. O Chakra responsável pelas emoções é o cardíaco, sendo assim um órgão ligado ao básico pode receber influência de outros Chakras através dos nadis, o também explica os surgimentos de certas enfermidades.
